>>> CONVOCATORIA CERRADA <<<

• Proporcionar a los asistentes los conceptos y habilidades básicas de herramientas bioinformáticas para el manejo y análisis de datos genómicos, transcriptómicos y metagenómicos.
• Proporcionar las bases metodológicas para el diseño experimental en estas áreas.
• Proporcionar las bases suficientes para interpretar resultados de análisis de datos y generar información de utilidad.

• Bioinformatica en línea de comandos. (Sistema Operativo UNIX)


• Introducción a las tecnologías de Secuenciación Masiva, control de calidad, filtrado y limpieza de datos.
  Alineamiento y manejo de las herramientas bamtools y samtools.


• Ensamblado de Novo de genomas.


• Introducción a R.


• Ensamblado y Análisis metagenómico.


• Ensamblado de Novo de transcriptoma y análisis de expresión diferencial de genes o transcritos.


• Vigilancia genómica y Metodologías de inferencia filogenética.

El Curso está dirigido a público en general (nacional e internacional) con conocimientos en biología, computación y/o afines, con interés en biología molecular, genómica y bioinformática.

Es necesario contar con equipo de cómputo para tomar los cursos, a menos que lo tome presencial, en cuyo caso será proporcionado el equipo.
El sistema operativo del equipo de cómputo puede ser cualquier distribución de Linux, MacOS, o Windows, este último con algún emulador de terminal, como MobaXterm (en windows 10 existe una versión de terminal llamada Power Shell).

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Se extenderá constancia de participación a los asistentes que concluyan el proceso de inscripción, realicen el pago correspondiente, cubran con los horarios y actividades correspondientes a los módulos tomados.
(La constancia se extenderá validando solo los módulos tomados, para más información consulte la sección de DISEÑO Y METODOLOGÍA DEL CURSO en esta misma página.)

El curso se llevará a cabo de manera híbrida usando la plataforma Zoom y de forma presencial en las instalaciones del IBt:
(Av. Universidad 2001, Col. Chamilpa Cuernavaca Morelos, México), al inscribirse al curso usted recibirá un correo de confirmación con instrucciones para continuar su proceso de inscripción.
Las sesiones serán grabadas y permanecerán disponibles en youtube, además habrá apoyo técnico para la instalación de los ambientes de terminal tipo Linux, y resolución de problemas durante todo el evento.
Debido a la situación sanitaria con fines de garantizar el cumplimiento de las normas de seguridad y salud, en la modalidad presencial se recibirá un aforo máximo de 15 personas.
La inscripción al curso no contempla hospedaje ni comida , estas deberán ser cubiertas por el alumno interesado.
En la modalidad virtual se recibirá un aforo máximo de 65 personas.
El curso esta divido en 6 módulos que puede revisar en el apartado PROGRAMA descrito en esta página.
Las constancia se extenderá especificando los módulos cubiertos por el estudiante. Se debe asistir a todas las sesiones de cada módulo para ser acreedor a su mención en la constancia.
Para comentarios y dudas contactarse vía el correo: curso_uusmb@ibt.unam.mx

El curso se llevará a cabo en formato híbrido martes y jueves de 9:00 a.m. a 14:00 p.m. (hora centro México ) del Martes 30 de mayo al jueves 22 de junio, y el 27,28 y 29 de Junio del 2023, cubriendo un total de 61 hrs en 11 días, 45 horas sincrónicas y al menos 16 asincrónicas.

• $200 USD, ($4000.00 MXN).
• La recepción de solicitudes de beca quedo concluida el día 27 de marzo del 2023.
• Los solicitantes que sean estudiantes tienen posibilidad de solicitar beca del 50%, para lo cual se requiere :
  a) Un comprobante que lo acredite como estudiante.
  b) Una carta de apoyo por parte de asesor.
  c) Una carta de motivos por los que se solicta la beca.
  d) una carta compromiso de que no puede abandonar el curso o faltar a ninguna clase.
• Nota: es importante mencionar que en el caso de los solicitantes de beca, al momento de seleccionar el curso al cual desea inscribirse, se le solicitará un único archivo en formato pdf que deberá incluir: comprobante de estudios, carta de apoyo del asesor y carta compromiso del alumno.

Los costos antes mencionados incluyen una membresía por un año a la Red Mexicana de Bioinformática ó el descuento del 10% al 20% a los miembros activos. La lista de aceptados se irá publicando según se aprueben y validen sus documentos y pagos.

El pago se podrá realizar en dólares ($200.00) o en pesos mexicanos ($4,000.00).
Una vez que el interesado llene la SOLICITUD DE INSCRIPCIÓN eligiendo el curso al que se desea inscribir, podrá realizar su pago con las instrucciones que les enviaremos a su correo electrónico. También es importante mencionar que al momento de realizar el pago, es importante definir como concepto: 'CURSO UUSMB'

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Nota: es importante mencionar que en el caso de los solicitantes de beca, al momento de seleccionar el curso al cual desea inscribirse, se le solicitará un único archivo en formato pdf que deberá incluir: comprobante de estudios, carta de apoyo del asesor y carta compromiso del alumno.

Se recibirán solicitudes en nuestro portal de cursos SAC (Sistema de Administración de Cursos) a partir del Martes 7 de Febrero 2023 y hasta cubrir el cupo máximo de personas. Todas las solicitudes que se reciban posterior a cubrir el cupo quedarán en lista de espera, favor de enviar correo a: curso_uusmb@ibt.unam.mx

• Para inscribirte al curso ingresa al siguiente sitio : SAC (Sistema de Administración de Cursos)
• Después de registrarte( si eres nuevo usuario) o bien haber iniciado sesión debes elegir el curso al que deseas inscribirte.
• Manual de ayuda para conocer nuestro Sistema de Administracion de Cursos

Módulo 1 (Obligatorio)

Día 1. Martes 30 de Mayo de 2023. Bioinformatica en línea de comandos. (Sistema Operativo UNIX)

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Instalación de un ambiente unix e introducción a los sistemas operativos en línea de comandos.	MC. Jérôme Verleyen
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 13:45	Línea de comandos en linux	MC. Jérôme Verleyen
13:45 - 14:00	Resolución de ejercicios y dudas

Día 2. Jueves 01 de Junio de 2023. Bioinformatica en línea de comandos. (Sistema Operativo UNIX)

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Línea de comando en linux	MC. Jérôme Verleyen
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 13:45	Línea de comandos en linux	MC. Jérôme Verleyen
13:45 - 14:00	Resolución de ejercicios y dudas

Módulo 2 (Obligatorio)

Día 3. Martes 6 de Junio de 2023. IntIntroducción a las tecnologías de Secuenciación Masiva, control de calidad, filtrado y limpieza de datos.
Alineamiento y manejo de las herramientas bamtools y samtools.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 10:00	Introducción a las metodologías de Secuenciación Masiva	Dr. Alejandro Sánchez Dr. Ricardo Grande
10:00 - 11:15	Análisis Primario de Secuenciación	MC. Verónica Jiménez Dra. Leticia Vega
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Alineamiento	Dr. Alejandro Sánchez MC. Jérôme Verleyen

Día 4. Jueves 8 de Junio de 2023. Ensamblado de Novo de genomas.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Introducción a los conceptos básicos de reconstrucción de secuencias. – OLC – Gráficas de De Bruijn	MC. Karel Estrada Dr. Alejandro Sánchez
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 12:00	Herramientas para llevar a cabo ensamblado de genomas de novo con lecturas cortas y lecturas largas Predicción y anotación de Genes	MC. Karel Estrada Dr. Alejandro Sánchez

Módulo 3 (Obligatorio)

Día 5. Martes 13 de Junio de 2023. Introducción a R .

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Introducción a R. De variables a Data Frames	Dra. Leticia Vega MC. Verónica Jiménez
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Graficando datos con ggplot	Dra. Leticia Vega MC. Verónica Jiménez

Módulo 4 (Opcional)

Día 6. Jueves 15 de Junio de 2023. Ensamblado y Análisis metagenómico.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Introducción amplicones 16S, ecología microbiana	Dra. Ernestina Godoy Dr. Alejandro Sánchez
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Análisis de secuencias de amplicones 16S: Qiime2. Análisis Bioinformático: Archivos de entrada Proceso: Demux, para leer los archivos de entrada Dada2, Inferencia de ASV(OTUS) para datos de amplicones Visualizar salida de Dada2 (resumen, secuencias y tabla de conteos Anotacion taxonómica (con blast, vsearch o sklearn) contra Silva132 Core metrics, diversidad alfa y beta	Dra. Ernestina Godoy Dr. Alejandro Sánchez

Día 7. Martes 20 de Junio de 2023. Ensamblado y Análisis metagenómico.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Análisis de resultados de 16s con R, con librerías qiime2R	Dra. Ernestina Godoy Dra. Leticia Vega
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Análisis de resultados de 16s con R, con librerías qiime2R	Dra. Ernestina Godoy Dra. Leticia Vega

Módulo 5 (Opcional)

Día 8. Jueves 22 de Junio de 2023. Ensamblado de Novo de transcriptoma y análisis de expresión diferencial de genes o transcritos.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Introducción al Transcriptoma de Novo Con Trinity	MC. Jérôme Verleyen MC. Verónica Jiménez
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Transcriptoma de Novo Con Trinity	MC. Jérôme Verleyen MC. Verónica Jiménez

Día 9. Martes 27 de Junio de 2023. Ensamblado de Novo de transcriptoma y análisis de expresión diferencial de genes o transcritos.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Expresión diferencial	Dra. Leticia Vega MC. Verónica Jiménez
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Expresión diferencial	Dra. Leticia Vega MC. Verónica Jiménez

Módulo 6 (Opcional)

Día 10. Miércoles 28 de Junio de 2023. Vigilancia genómica y Metodologías de inferencia filogenética.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Filogenómica	Dra.Blanca Taboada
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Filogenómica	Dra.Blanca Taboada

Día 11. Jueves 29 de Junio de 2023. Vigilancia genómica y Metodologías de inferencia filogenética.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Genómica Viral	Dra.Blanca Taboada
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Genómica Viral	Dra.Blanca Taboada

• Dr. Fidel Alejandro Sanchez Flores
• Dr. Ricardo Alfredo Grande Cano
• M.C. Karel Johan Estrada Guerra
• M.C Jerome Jean Verleyen
• Biol.Gloria Tanahiry Vazquez Castro
• M.C. Veronica Jimenez Jacinto
• Dra. Leticia Vega Alvarado
• Dra. Elizabeth Ernestina Godoy Lozano
• Dra. Blanca Itzelt Taboada Ramirez
• Dra. Iliana Chantal Martinez Ortiz
• Ing. Ilse Patricia Salinas Peralta
• Ing. Karla Leslie Matias Valdez

Puedes ver el perfil de algunos de los ponentes y ayudantes en nuestro apartado de personal.