Convocatoria: Curso UUSMB-INSP Herramientas para bioinformática Noviembre 2024

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El Laboratorio Nacional de Apoyo Tecnológico a las Ciencias Genómicas, a través de la Unidad Universitaria de Secuenciación Masiva y Bioinformática, con sede en el Instituto de Biotecnología de la UNAM en conjunto con el Instituto Nacional de Salud Pública y el Centro de Investigación Sobre Enfermedades Infecciosas tenemos el placer de invitarlos al curso de:
HERRAMIENTAS PARA BIOINFORMÁTICA NOVIEMBRE 2024

  • Proporcionar a los asistentes los conceptos y habilidades básicas para el uso de las interfaces de la linea de comandos UNIX.
  • Proporcionar los fundamentos básicos del funcionamiento de Git y hacer uso de un sistema automático de control de versiones.
  • Proporcionar las bases de lenguaje de programación Python para el análisis de datos.

  • La Terminal Unix

  • Control de verisones con Git

  • Programando con Python

El curso está dirigido a estudiantes y otros investigadores con interés en el análisis de datos a través de la programación.
No es necesario tener conocimientos previos de las herramientas que se presentarán en el taller.

REQUISITOS:

  • Es necesario contar con una computadora en la que tengan privilegios administrativos, esta debe contar con un sistema operativo Mac,Linux o Windows 8 o superior.
  • Instalar el cliente de videoconferencia, en nuestro caso usaremos Zoom para las sesiones, puedes descargarlo desde la siguiente liga: Descargar Zoom
  • Acceso a una terminal o emulador de terminal:
    Por defecto cualquier distribución Linux o MacOS ya cuentan con una terminal preinstalada, busca en tu explorador de apps "terminal".
    Para sistemas operativos Windows, a partir de la version 8 o superiores cuentan con la terminal preinstalada PowerShell (Revisa en tu explorador de apps que la tengas instalada).
    Si no cuentas con la instalación o quieres probar otras alternativas a esta terminal puedes instalar alguna de estas terminales:
    - Instalar MobaXterm
    - Instalar Putty
    - Instalar el subsistema Ubuntu en Windows 10
  • Git: Es un sistema de control de versiones que te permite rastrear quien hizo qué y cuando, y tiene opciones para actualizar fácilmente una versión compartida o pública de tu código en github.com
    Necesitarás un navegador compatible, para una mejor experiencia se recomienda usar Chrome,Edge,Firefox o Safari.
    Crea una cuenta en github.com para seguir la práctica guiada en el módulo de Git
    - ¿Cómo crear una cuenta en Git?
    Asegurate de terner la autenticación multifactor activada, algunos métodos de autenticación y su guia aqui:
    - Configuración de autenticación de dos factores
  • Asegúrese de tener un servicio de internet con velocidad de descarga y subida de 30 a 40 Mbps (Mínimo). Pruebe su velocidad en: SpeedTest
  • IMPORTANTE: En caso de tener algun problema con la instalación, el Viernes 22 de Noviembre se brindará asistencia técnica para resolución de problemas


    Se extenderá constancia de participación a los asistentes que concluyan el proceso de inscripción, realicen el pago correspondiente, cubran con los horarios y actividades correspondientes a los módulos tomados.

    El curso se llevará a cabo de manera ONLINE, es decir;

    • Usaremos la plataforma zoom para conectarnos en videoconferencia, y seguiremos las intrucciones de cada ponente.
      Para para seguir con cada módulo sin interrupciones, se deberá realizar las instalaciones pertinentes en el apartado PERFIL DE PÚBLICO ASISTENTE > REQUISITOS .
      Para los módulos La terminal Unix y Control de versiones con Git nos conectaremos a un servidor remoto via SSH (Secure Shell) y ahi ejecutaremos los comandos.
      Para el módulo Programando con Python nos conectaremos a un servidor Jupyter
    • Solo se recibirá un aforo máximo de 25 personas usando la plataforma Zoom.


    Al inscribirse al curso usted recibirá un correo de confirmación con instrucciones para continuar su proceso de inscripción.
    Las sesiones serán grabadas y permanecerán disponibles en youtube, además,habrá apoyo técnico para la instalación de los ambientes de terminal tipo Linux, y resolución de problemas durante todo el evento.

    El curso esta divido en 3 módulos que puede revisar en el apartado PROGRAMA descrito en esta página.
    Las constancia se extenderá al finalizar el evento y los asistentes deberán haber cubierto el 80% de las clases para ser acreedor a la constancia de participación.

    Para comentarios y dudas contactarse vía el correo: curso_uusmb@ibt.unam.mx

    El curso se llevará a cabo en formato Online( es decir por videoconferencia y a través de código vivo)

    Jueves 28 y Viernes 29 de Noviembre del 2024 de 9:00 hrs a 14:00 hrs y de 15:00 hrs a 18:30 hrs (GMT-6 ).
    Cubriendo un total de 14 hrs en 2 días.

    Iniciamos el Jueves 28 de Noviembre y finalizamos el dia Viernes 29 de Noviembre del 2024.

    El costo del curso para el público en general es de $1200.00 MXN ( mil dos cientos pesos mexicanos)
    El costo del curso para estudiantes es de $1000.00 MXN ( mil pesos mexicanos)

    etapas
    • Los solicitantes que sean estudiantes tendran que presentar la siguiente documentación:
      a) Un comprobante que lo acredite como estudiante.
      b) Una carta de apoyo por parte de asesor.
      c) una carta compromiso de que no puede abandonar el curso o faltar a ninguna clase.

    ESTUDIANTES: Al momento de seleccionar el curso al cual desea inscribirse, se le solicitará un único archivo en formato pdf que deberá incluir: comprobante de estudios, carta de apoyo del asesor y carta compromiso del alumno.

    • La uusmb comprometida con educación, otorgará 3 becas del 100% de descuento (sólo pueden solicitar esta beca los estudiantes)
      Para solicitar esta beca el estudiante deberá presentar la siguiente documentación:
      a) Un comprobante que lo acredite como estudiante.
      b) Una carta de apoyo por parte de asesor.
      c) una carta compromiso de que no puede abandonar el curso o faltar a ninguna clase.
      d) Una carta de motivos por los que se solicta la beca.

    SOLICITANTES DE BECA: Al momento de seleccionar el curso al cual desea inscribirse, se le solicitará un único archivo en formato pdf que deberá incluir: comprobante de estudios, carta de apoyo del asesor y carta compromiso del alumno.

    Sólo se otorgarán un máximo de 3 becas del 100% de descuento y estarán a consideración del cómite organizador, la fecha límite para enviar su solicitud de beca es el 08 de Noviembre del 2024

    Se podrán realizar PAGOS NACIONALES (MÉXICO) en pesos mexicanos (MXN), a través de transferencia bancaria o depósito en ventanilla con un número de ficha referenciada

    Se podrán realizar PAGOS INTERNACIONALES (EXTRANJERO) dólares americanos (USD), a través de código SWIFT en JPMorgan

    VERIFIQUE LOS COSTOS ANTES DE REALIZAR SU PAGO

    etapas

    Una vez que el interesado llene la SOLICITUD DE INSCRIPCIÓN en nuestro sistema de administración de cursos eligiendo el curso al que se desea inscribir, podrá realizar el pago con las instrucciones que le serán enviadas a su correo electrónico.

    Al momento de realizar el pago, DEFINIR COMO CONCEPTO DE PAGO: " UUSMB 2024".
    Guardar el comprobante de pago del asistente SIN ACENTOS, SIN ESPACIOS EJEMPLO: JUAN_PEREZ.pdf

    Se podrá emitir factura siempre y cuando se solicite en el mes que se efectuó el pago y el solictante comparta los datos fiscales PERSONALES o de su INSTITUCION para emitirla.

    UNA VEZ EMITIDA LA FACTURA NO SE PODRÁN REALIZAR CAMBIOS, Corrobore los datos fiscales antes de solicitarla
    LA UNAM NO FACTURA A LA UNAM , tome en cuenta esto para solicitar su factura


    SOLICITANTES DE BECA: Dentro de la plataforma SAC, al momento de seleccionar el curso al cual desea inscribirse, se le solicitará un único archivo en formato pdf que deberá incluir: comprobante de estudios, carta de apoyo del asesor y carta compromiso del alumno.

    Se recibirán solicitudes en nuestro portal de cursos SAC (Sistema de Administración de Cursos) a partir del Miércoles 23 de Octubre 2024 y hasta cubrir el cupo máximo de personas. Todas las solicitudes que se reciban posterior a cubrir el cupo quedarán en lista de espera, favor de enviar correo a: curso_uusmb@ibt.unam.mx

    Día 1: 28 de Noviembre 2024

    Día 1. Jueves 28 de Octubre de 2024. UNIX


    HORARIO TEMA PONENTE
    09:00 - 11:00 El Shell de Linux Dr. Alejandro Sánchez
    11:00 - 11:30 Receso
    11:30 - 14:00 El Shell de Linux continuación Dr. Alejandro Sánchez

    Día 1. Jueves 28 de Octubre de 2024. Control de versiones con Git


    HORARIO TEMA PONENTE
    15:00 - 16:45 Control de versiones con Git MC. Jérôme Verleyen
    16:45 - 17:15 Receso
    17:15 - 18:30 Control de versiones con Git continuación Dr. Karel Estrada

    Día 2: 29 de Noviembre 2024

    Día 2. Viernes 29 de Noviembre de 2024. Python primera parte


    HORARIO TEMA PONENTE
    09:00 - 11:00 Programando con Python Ing. Leslie Matías
    11:00 - 11:30 Receso
    11:30 - 14:00 Programando con Python continuación Ing. Leslie Matías

    Día 2. Viernes 29 de Noviembre de 2024. Python segunda parte


    HORARIO TEMA PONENTE
    15:00 - 16:45 Programando con Python MC. Verónica Jiménez
    16:45 - 17:15 Receso
    17:15 - 18:30 Programando con Python continuación MC. Verónica Jiménez

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