>>> CONVOCATORIA 2024: CUPO LLENO <<<

• Proporcionar a los asistentes los conceptos y habilidades básicas de herramientas bioinformáticas para el manejo y análisis de datos genómicos, transcriptómicos y metagenómicos.
• Proporcionar las bases metodológicas para el diseño experimental en estas áreas.
• Proporcionar las bases suficientes para interpretar resultados de análisis de datos y generar información de utilidad.

Introducción a las tecnologías de Secuenciación Masiva

• Bioinformatica en línea de comandos. (Sistema Operativo UNIX)


• Control de calidad, filtrado y limpieza de datos.
  Alineamiento y manejo de las herramientas bamtools y samtools.


• Ensamblado de Novo de genomas.


• Introducción a R.


• Ensamblado y Análisis metagenómico.


• Ensamblado de Novo de transcriptoma y análisis de expresión diferencial de genes o transcritos.


• Vigilancia genómica

El Curso está dirigido a público en general (nacional e internacional) con conocimientos en:

Biología, Computación y/o afines

con interés en:

Biología molecular, Genómica y Bioinformática.

REQUISITOS:

Es necesario contar con una computadora personal, a menos que el asistente tome el curso de manera presencial, en cuyo caso será proporcionado el equipo.

Acceso a un emulador de terminal, por defecto cualquier distribución Linux o MacOS ya cuentan con una terminal preinstalada

Emulador para usuarios Windows: Algunas versiones de windows cuentan con la terminal PowerShell preinstalada , en caso contrario se pueden instalar otros emuladores de terminal como: Putty ó MobaXterm

Asegúrese de tener un servicio de internet con velocidad de descarga y subida de 30 a 40 Mbps (Mínimo). Pruebe su velocidad en: SpeedTest

Instalación de Zoom para las videoconferencias Zoom

IMPORTANTE: En caso de tener algun problema con la instalación, el lunes 03 de Junio se brindará asistencia técnica para resolución de problemas

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Se extenderá constancia de participación a los asistentes que concluyan el proceso de inscripción, realicen el pago correspondiente, cubran con los horarios y actividades correspondientes a los módulos tomados.
(La constancia se extenderá validando solo los módulos tomados, para más información consulte la sección de DISEÑO Y METODOLOGÍA DEL CURSO en esta misma página.)

El curso se llevará a cabo de manera híbrida, es decir;

• En la MODALIDAD PRESENCIAL se recibirá un aforo máximo de 15 personas (las primeras 15 que lo soliciten a través de la solicitud de inscripción) en las instalaciones del IBt(Av. Universidad 2001, Col. Chamilpa Cuernavaca Morelos, México)
  
  Esto debido a la situación sanitaria y con fines de garantizar el cumplimiento de las normas de seguridad y salud.
  La inscripción al curso NO CONTEMPLA hospedaje, este deberán ser cubierto por el alumno interesado.
  
  
• En la MODALIDAD VIRTUAL se recibirá un aforo máximo de 55 personas usando la plataforma Zoom

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Al inscribirse al curso usted recibirá un correo de confirmación con instrucciones para continuar su proceso de inscripción.
Las sesiones serán grabadas y permanecerán disponibles en youtube, además,habrá apoyo técnico para la instalación de los ambientes de terminal tipo Linux, y resolución de problemas durante todo el evento.

El curso esta divido en 7 módulos que puede revisar en el apartado PROGRAMA descrito en esta página.
Las constancia se extenderá especificando los módulos cubiertos por el estudiante. Se debe asistir al 80% de las clases para ser acreedor a la constancia de participación.

Para comentarios y dudas contactarse vía el correo: curso_uusmb@ibt.unam.mx

El curso se llevará a cabo en formato híbrido (es decir con asistentes presenciales y asistententes online)

Lunes, Miércoles y Viernes de 9:00 a.m. a 14:00 p.m. (hora centro México ).
Cubriendo un total de 75 hrs en 12 días, 60 horas en clase y al menos 15 hrs con trabajo en casa .

Iniciamos el Lunes 03 de Junio y finalizamos el dia Viernes 28 de Junio del 2024.

El costo original del curso para el público en general es de $235 USD ($4000.00 MXN, cuatro mil pesos mexicanos)

• Los solicitantes que sean estudiantes tienen posibilidad de solicitar beca del 50%, para lo cual se requiere :
  a) Un comprobante que lo acredite como estudiante.
  b) Una carta de apoyo por parte de asesor.
  c) Una carta de motivos por los que se solicta la beca.
  d) una carta compromiso de que no puede abandonar el curso o faltar a ninguna clase.

SOLICITANTES DE BECA: Al momento de seleccionar el curso al cual desea inscribirse, se le solicitará un único archivo en formato pdf que deberá incluir: comprobante de estudios, carta de apoyo del asesor y carta compromiso del alumno.

Para facilitar el acceso a cursos de alta especialidad como son las ciencias ómicas, el Laboratorio Nacional de Apoyo Tecnológico a las Ciencias Genómicas pone a sus disposición los siguientes DESCUENTOS POR PRONTO PAGO sobre el CURSO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMÁTICAS JUNIO 2024:

IMPORTANTE: Los costos antes mencionados incluyen una membresía por un año a la Red Mexicana de Bioinformática ó el descuento del 10% al 20% a los miembros activos. La lista de aceptados se irá publicando según se aprueben y validen sus documentos y pagos.

Se podrán realizar PAGOS NACIONALES (MÉXICO) en pesos mexicanos (MXN), a través de transferencia bancaria o depósito en ventanilla.

Se podrán realizar PAGOS INTERNACIONALES a través de transferencia bancaria con código SWIFT

VERIFIQUE LOS COSTOS POR ETAPA ANTES DE REALIZAR SU PAGO
Una vez que el interesado llene la SOLICITUD DE INSCRIPCIÓN eligiendo el curso al que se desea inscribir, podrá realizar el pago con las instrucciones que le serán enviadas a su correo electrónico.

Al momento de realizar el pago, DEFINIR COMO CONCEPTO DE PAGO: " UUSMB 2024".
Guardar el comprobante de pago del asistente SIN ACENTOS, SIN ESPACIOS EJEMPLO: JUAN_PEREZ.pdf

Se podrá emitir factura siempre y cuando se solicite en el mes que se efectuó el pago y el solictante comparta los datos fiscales PERSONALES o de su INSTITUCION para emitirla.

UNA VEZ EMITIDA LA FACTURA NO SE PODRÁN REALIZAR CAMBIOS, CORROBORE LOS DATOS FISCALES ANTES DE SOLICITARLA

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SOLICITANTES DE BECA: Dentro de la plataforma SAC, al momento de seleccionar el curso al cual desea inscribirse, se le solicitará un único archivo en formato pdf que deberá incluir: comprobante de estudios, carta de apoyo del asesor y carta compromiso del alumno.

Se recibirán solicitudes en nuestro portal de cursos SAC (Sistema de Administración de Cursos) a partir del Jueves 01 de Febrero 2024 y hasta cubrir el cupo máximo de personas. Todas las solicitudes que se reciban posterior a cubrir el cupo quedarán en lista de espera, favor de enviar correo a: curso_uusmb@ibt.unam.mx

• Para inscribirte al curso ingresa al siguiente sitio : SAC (Sistema de Administración de Cursos)
• Después de registrarte( si eres nuevo usuario) o bien haber iniciado sesión debes elegir el curso al que deseas inscribirte.
• Manual de ayuda para conocer nuestro Sistema de Administracion de Cursos

Introducción

Día 1. Lunes 03 de Junio de 2024. Sesión introductoria
Introducción a las tecnologías de Secuenciación Masiva,

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 10:00	Conexión al servidor(windows, mac, linux),Secure Copy	MC. Jérôme Verleyen
10:00 - 11:00	Presentación de profesores, ayudantes, Red Mexicana de bioinformatica, reglas del curso e inducción al moodle.	Dr. Alejandro Sánchez
11:00 - 11:50	Receso
12:00 - 13:00	Visita guiada a la UUSMB	Dr. Ricardo Grande Cano
01:00 - 14:00	Introducción a las metodologías de Secuenciación Masiva y el diseño de experimentos	Dr. Alejandro Sánchez Dr. Ricardo Grande Cano

Módulo 1

Día 2. Miércoles 05 de Junio de 2024. Bioinformatica en línea de comandos. (Sistema Operativo UNIX)

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Instalación de un ambiente unix e introducción a los sistemas operativos en línea de comandos.	MC. Jérôme Verleyen
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 13:45	Línea de comandos en linux	MC. Jérôme Verleyen
13:45 - 14:00	Resolución de ejercicios y dudas

Día 3. Viernes 07 de Junio de 2024. Bioinformatica en línea de comandos. (Sistema Operativo UNIX)

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Línea de comando en linux	MC. Jérôme Verleyen
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 13:45	Línea de comandos en linux	MC. Jérôme Verleyen
13:45 - 14:00	Resolución de ejercicios y dudas

Módulo 2

Día 4. Lunes 10 de Junio de 2024. Control de calidad, filtrado y limpieza de datos.
Alineamiento y manejo de las herramientas bamtools y samtools.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 10:00	Análisis Primario de Secuenciación (análisis de calidad, filtrado de calidad)	MC. Verónica Jiménez Dra. Leticia Vega
10:00 - 11:15	Alineamiento de secuencias cortas	MC. Karel Estrada Dr. Alejandro Sánchez
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Alineamiento de secuencias cortas	MC. Karel Estrada Dr. Alejandro Sánchez

Módulo 3

Día 5. Miércoles 12 de Junio de 2024. Ensamblado de Novo de genomas.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Introducción a los conceptos básicos de reconstrucción de secuencias. – OLC – Gráficas de De Bruijn	MC. Karel Estrada Dr. Alejandro Sánchez
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 12:00	Herramientas para llevar a cabo ensamblado de genomas de novo con lecturas cortas y lecturas largas Predicción y anotación de Genes	MC. Karel Estrada Dr. Alejandro Sánchez

Módulo 4

Día 6. Viernes 14 de Junio de 2024. Introducción a R .

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Introducción a R. De variables a Data Frames	Dra. Leticia Vega MC. Verónica Jiménez
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Graficando datos con ggplot	Dra. Leticia Vega MC. Verónica Jiménez

Día 7. Lunes 17 de Junio de 2024. Ensamblado y Análisis metagenómico.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Introducción amplicones del gen rRNA 16S, ecología microbiana	Dra. Ernestina Godoy Dr. Alejandro Sánchez
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Análisis de secuencias de amplicones 16S: Qiime2.	Dra. Ernestina Godoy Dr. Alejandro Sánchez

Día 8. Miércoles 19 de Junio de 2024. Ensamblado y Análisis metagenómico.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Análisis de resultados del gen 16s rRNA con R	Dra. Ernestina Godoy Dra. Leticia Vega
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Análisis de resultados del gen 16s con R	Dra. Ernestina Godoy Dra. Leticia Vega

Módulo 5

Día 9. Viernes 21 de Junio de 2024. Ensamblado de transcriptoma de Novo y análisis de expresión diferencial de genes o transcritos.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Introducción al Transcriptoma de Novo Con Trinity	MC. Verónica Jiménez MC. Jérôme Verleyen
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Transcriptoma de Novo Con Trinity	MC. Verónica Jiménez MC. Jérôme Verleyen

Día 10. Lunes 24 de Junio de 2024. Ensamblado de transcriptoma de Novoy análisis de expresión diferencial de genes o transcritos.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Expresión diferencial	Dra. Leticia Vega MC. Verónica Jiménez
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Expresión diferencial	Dra. Leticia Vega MC. Verónica Jiménez

Módulo 6

Día 11. Miércoles 26 de Junio de 2024. Vigilancia genómica.

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Vigilancia genómica	Dra.Blanca Taboada
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Vigilancia genómica	Dra.Blanca Taboada

Día 12. Viernes 28 de Junio de 2024. Vigilancia genómica

HORARIO	TEMA	PONENTE
09:00 - 11:15	Vigilancia genómica	Dra.Blanca Taboada
11:15 - 11:45	Receso
11:45 - 14:00	Vigilancia genómica	Dra.Blanca Taboada

• Dr. Fidel Alejandro Sanchez Flores
• Dr. Ricardo Alfredo Grande Cano
• M.C. Karel Johan Estrada Guerra
• M.C Jerome Jean Verleyen
• M.C. Veronica Jimenez Jacinto
• Dra. Leticia Vega Alvarado
• Dra. Elizabeth Ernestina Godoy Lozano
• Dra. Blanca Itzelt Taboada Ramirez
• Biol.Gloria Tanahiry Vazquez Castro
• I.Q.Lizeth Arely Matias Valdez
• Ing. Ilse Patricia Salinas Peralta
• Ing. Karla Leslie Matias Valdez

Puedes ver el perfil de algunos de los ponentes y ayudantes en nuestro apartado de personal.